脑囊虫为一新型广谱抗寄生虫药。这些吸虫病以及绦虫病、华支睾吸虫病，肺吸虫病等均有效。因为吡喹酮毛蚴也有杀灭效率，所以也用于防备血吸虫沾染。也有以吡喹酮医治脑囊虫病。
吡喹酮用量用法： 口服：每次每千克体重10mg，连服2日。或每次每千克体重20mg，1日3次，服1日。 于停药数小时至1、2日内即消逝。成年病人服药后大重大心、肝、肾病者及有肉体病史者慎用吡喹酮。 多心率减慢，儿童则多数心率增快。
注重事项：在服首剂1小时后可涌现头昏、头痛、乏力、腹痛、关节酸痛、腰酸、腹胀、恶心、腹泻、失眠、多汗、肌束震颤、早搏等，个别无需解决，偶见心电图转变（房性或室性早搏、T波压高等）、血清转氨酶降低、中毒性肝炎等。并可诱发肉体正常及消化道出血；脑疝、过敏反映（皮疹、哮喘）等亦有所见。
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